8月5日，院作物研究所特色糧油研究室在《Journal of Genetics and Genomics》（中科院一區(qū)，IF：7.1）發(fā)表題為“Chromosome-level genome assembly of finger millet （Eleusine coracana） provides insights into drought resistance”的研究性論文。作物所李基光研究員、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院關(guān)超男博士后、安諾優(yōu)達(dá)基因科技（北京）股份有限公司李曉波工程師和作物所王艷蘭助理研究員為該論文共同第一作者，湯睿副研究員和中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院周美亮研究員為共同通訊作者。

 

　　穇子為禾本科穇屬一年生草本植物，是僅次于高粱、珍珠粟、谷子的第四大粟類作物，在湖南、貴州、廣西、陜西和西藏等地廣泛種植。穇子根系發(fā)達(dá)，耐干旱，能在短暫缺水的情況下正常生長，在抗旱育種方面有較大應(yīng)用潛力。該研究構(gòu)建了一個(gè)異源四倍體穇子栽培品種的高質(zhì)量染色體水平基因組圖譜，揭示了其兩個(gè)亞基因組（subA和subB）之間存在廣泛的結(jié)構(gòu)重排。研究顯示subB約680萬年前與其祖先種Eleusine indica分化，并經(jīng)歷了兩次全基因組復(fù)制事件，這些事件塑造了當(dāng)前的基因組結(jié)構(gòu)，促進(jìn)了基因冗余和廣泛的適應(yīng)性產(chǎn)生。利用101份穇子種質(zhì)資源，經(jīng)全基因組關(guān)聯(lián)分析（GWAS），鑒定出多個(gè)與千粒重、生育期及抗旱等關(guān)鍵農(nóng)藝性狀相關(guān)的候選基因，其中EcMDHAR（編碼單脫氫抗壞血酸還原酶）基因的不同單倍型呈現(xiàn)差異化表達(dá)模式，在增強(qiáng)抗旱性方面發(fā)揮關(guān)鍵作用。該基因組資源不僅推動(dòng)了對(duì)粟類作物多倍體基因組進(jìn)化的理解，也為穇子農(nóng)藝品質(zhì)性狀改良奠定了基礎(chǔ)。

 

　　A 穇子栽培種C142植株形態(tài)；B 穇子基因組圖譜；C 亞基因組A和B共線性分析；D 干旱指數(shù)GWAS曼哈頓圖；E EcMDHAR基因四種單倍型抗旱指數(shù)差異；F EcMDHAR四種單倍型表達(dá)水平分析

 

　　原文連接：https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S1673852725002097