為了保證《食品安全法》中食品安全國家標準有關工作的落實，規(guī)范食品安全標準管理工作，衛(wèi)生部起草并發(fā)布了《食品安全國家標準管理辦法》。（辦法全文見：食品安全國家標準管理辦法（衛(wèi)生部令第77號））

    該辦法分七章，包括：總則，規(guī)劃、計劃和立項，起草，審查，批準和發(fā)布，修改和復審，附則，共計四十二條。

    《辦法》規(guī)定了食品安全國家標準規(guī)劃和制（修）訂計劃的內容及制定程序、標準起草過程要求、公開征求意見要求、標準審查程序、標準批準發(fā)布形式及實施后的管理等。

    《辦法》從內容上體現(xiàn)出以下特點：

    一是強調了標準制定過程的科學性，要求以食品安全風險評估結果和食用農產品質量安全風險評估結果為制定標準的主要依據，參照國際食品法典標準，同時充分考慮我國的社會經濟發(fā)展水平。

    二是在標準起草、審查等環(huán)節(jié)均體現(xiàn)了公開透明原則。要求標準在起草完成后，應當書面征求標準使用單位、科研院校、行業(yè)和企業(yè)、消費者、專家、監(jiān)管部門等各方面意見。經審評委員會秘書處初審通過的標準，要在衛(wèi)生部網站上公開征求意見。

    三是鼓勵社會廣泛參與食品安全國家標準工作。任何單位和個人都可以提出標準制（修）訂的建議，對公開征求意見的標準草案發(fā)表意見，對標準實施過程中存在的問題提出意見和建議。

    四是突出標準審查工作的重要性。《食品安全法》規(guī)定食品安全國家標準應當經食品安全國家標準審評委員會審查通過。為了保證標準審查質量，根據《食品安全國家標準審評委員會章程》，將審評委員會內的審查細化為秘書處初審、專業(yè)分委員會審查、主任會議審議三個環(huán)節(jié)，同時增設衛(wèi)生部衛(wèi)生監(jiān)督中心審核環(huán)節(jié)。該中心多年來一直承擔著對各專業(yè)衛(wèi)生標準報批材料的審核工作，有豐富的工作經驗，增設此環(huán)節(jié)，有利于保證報至衛(wèi)生部的標準報批材料的規(guī)范性。

    據悉，2009年4月，在衛(wèi)生部發(fā)布的《衛(wèi)生標準管理辦法》的基礎上，根據《食品安全法》的有關規(guī)定，結合食品安全國家標準工作特點，衛(wèi)生部組織起草了《食品安全國家標準管理辦法（草案）》，并征求有關部委和各省級衛(wèi)生廳局的意見。2010年2月，衛(wèi)生部發(fā)布《食品安全國家標準審評委員會章程》后，根據章程和2009年7月20日公布的《食品安全法實施條例》，衛(wèi)生部對《草案》進行了修改完善，并再次征求有關部委和各省級衛(wèi)生廳局的意見。2010年4月30日至5月25日，衛(wèi)生部將《草案》在國務院法制辦網站向社會公開征求意見，共收到439條意見。根據收集到的反饋意見，衛(wèi)生部對《草案》作了進一步修改，最終形成了《食品安全國家標準管理辦法》。