隨著《國家食源性疾病分子溯源網(wǎng)絡管理規(guī)范》的印發(fā),標志著我國首個基于全基因組序列分型技術的新型食源性疾病分子溯源網(wǎng)絡建成,也標志著《食品安全標準與監(jiān)測評估“十四五”規(guī)劃》“加快國家食源性疾病分子溯源網(wǎng)絡(TraNet)建設,實現(xiàn)食源性致病性微生物全基因組關鍵分析技術的落地使用,全面提升食源性疾病調查溯源能力”任務的完成。
TraNet是在國家衛(wèi)生健康委、發(fā)改委、財政部、科技部共同支持下建立的基于全基因組序列數(shù)據(jù)、耐藥數(shù)據(jù)和流行病學信息集成的實驗室監(jiān)測網(wǎng)絡,是我國食源性疾病監(jiān)測技術體系的重要組成部分。網(wǎng)絡由國家、省、市三級聯(lián)動數(shù)據(jù)中心構成,包括沙門菌、志賀菌、副溶血性弧菌、致瀉大腸埃希菌、單核細胞增生李斯特菌、阪崎克羅諾桿菌、金黃色葡萄球菌和彎曲菌等常見食源性致病菌數(shù)據(jù)庫。全基因組測序是一種通過高通量測序技術解析細菌完整基因組序列的方法,能夠精確揭示細菌的全部遺傳信息。與傳統(tǒng)的分子分型技術相比,全基因組測序技術具有更高的分辨率和信息量。這一技術優(yōu)勢使公共衛(wèi)生專家能夠更準確地開展菌株比對分析,有效識別暴發(fā)相關菌株,及時追蹤食源性疾病暴發(fā)事件。通過全基因組測序技術的應用,可顯著提升流行病學專家建立食源性疾病與潛在污染食品之間關聯(lián)的能力,為食品安全監(jiān)測和暴發(fā)調查提供了強有力的技術支撐。網(wǎng)絡的建成為我國跨區(qū)域(甚至是國際間的)食源性疾病暴發(fā)的病因查明和精準溯源提供了有力的技術支撐,對保障公眾身體健康、生命安全,保護食品貿易,維護社會穩(wěn)定都具有重要的戰(zhàn)略意義。
網(wǎng)絡具有重要毒力因子、耐藥基因、血清分子分型等自動化分析模塊,滿足基層監(jiān)測技術機構對測序數(shù)據(jù)的自動分析,助力基層實驗室開展微生物致病和耐藥機制及遺傳進化等方面的應用基礎研究。同時,網(wǎng)絡可實現(xiàn)原始數(shù)據(jù)的實時采集、快速上報、安全傳輸。與國際同類應用技術綜合比較,新型食源性疾病分子溯源網(wǎng)絡以用戶友好的格式為使用人員提供精簡的運行管理界面和直觀的零代碼一鍵式自動分析應用程序,在數(shù)據(jù)庫類別、分析數(shù)據(jù)類型、運算速度、分析準確性、數(shù)據(jù)安全及使用操作性等方面處于國際“并跑”,甚至“領跑”地位。目前網(wǎng)絡已覆蓋全國32個省級和266家地市級疾病預防控制中心,已在泰國旅行相關腸炎沙門氏菌暴發(fā)病例的跨省溯源、冷凍飲品中單核細胞增生李斯特氏菌的跨省追蹤,北京腸炎沙門菌跨區(qū)暴發(fā)溯源調查等多起重大暴發(fā)事件調查中發(fā)揮作用并得到成功應用示范。