近日，中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院鄭州果樹研究所特色漿果與干果種質(zhì)改良課題組揭示了石榴重要經(jīng)濟(jì)性狀的遺傳機(jī)制。該研究組裝了首個石榴端粒到端粒參考基因組圖。鑒定了15個重要農(nóng)藝性狀的相關(guān)聯(lián)位點(diǎn)。揭示了控制石榴果皮顏色和籽粒硬度形成的遺傳機(jī)制，建立了石榴基因編輯體系，為石榴分子育種體系的建立奠定了基礎(chǔ)。相關(guān)研究成果發(fā)表在（植物生物技術(shù)雜志《Plant Biotechnology Journal》）上。
籽粒硬度和果皮顏色是決定石榴品質(zhì)性狀的重要指標(biāo)，解析石榴籽粒硬度和果皮顏色的遺傳機(jī)制可以為石榴果實(shí)品質(zhì)遺傳改良提供重要理論依據(jù)。
科研團(tuán)隊(duì)采用多種組裝策略，完成了首個石榴端粒到端粒參考基因組圖譜，該基因組包含8條染色體，總長度為366,710,298個堿基對，預(yù)測編碼蛋白基因32,158個。發(fā)現(xiàn)了非典型端?；蚩赡茉谇丝莆锓N進(jìn)化中發(fā)揮重要作用。依據(jù)全基因組關(guān)聯(lián)分析鑒定出15個重要農(nóng)藝性狀的相關(guān)聯(lián)位點(diǎn)16個。其中，1號染色體上37,193個堿基對的易位打斷了石榴花色苷合成酶基因編碼序列，導(dǎo)致葉片、花朵和果實(shí)（果皮和籽粒）花青素缺失。石榴花色苷還原酶基因啟動子區(qū)域特有的重復(fù)序列擴(kuò)增影響了其表達(dá)量進(jìn)而導(dǎo)致紫色果皮的形成?？刂剖褡蚜Ｓ捕然虻木幋a區(qū)單堿基非同義突變影響其與下游轉(zhuǎn)錄因子啟動子的結(jié)合，進(jìn)而影響石榴籽粒硬度。
該研究得到了國家自然科學(xué)基金、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院科技創(chuàng)新工程等項(xiàng)目的支持。
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https://onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1111/pbi.70107
