近日，中國農業(yè)科學院作物科學研究所水稻優(yōu)異種質資源發(fā)掘與創(chuàng)新利用創(chuàng)新團隊、作物種質資源安全保存與信息化創(chuàng)新團隊、作物生物信息與應用創(chuàng)新團隊聯(lián)合，首次系統(tǒng)揭示了中國主要稻區(qū)水稻品種的形成特征，相關研究成果發(fā)表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
我國每年水稻種植面積超過4億畝，覆蓋了從熱帶到寒溫帶的各類氣候區(qū)，形成了各具特色的水稻種植區(qū)。系統(tǒng)解析各稻區(qū)表型、基因型選擇特征，挖掘優(yōu)異種質基因及其組合，對加速我國水稻精準設計育種具有重要意義。
科研團隊對我國五大主要稻區(qū)的6044份現(xiàn)代水稻品種進行深度全基因組重測序，結合五大稻區(qū)19個鑒定點212組表型數(shù)據，系統(tǒng)闡明了不同稻區(qū)水稻品種基因組和表型選擇特征，多維度揭示了不同稻區(qū)品種適應性以及人文選擇影響。根據以上數(shù)據，鑒定到3131個與抽穗期、產量以及逆境響應等關鍵農藝性狀顯著相關的位點，并克隆到水稻粒形調控新基因OsGL3.6。進一步結合已發(fā)表數(shù)據，完成了近萬份水稻資源、品種的高密度變異圖譜的構建，并開發(fā)出在線育種輔助工具，打造了全球最大的水稻資源育種綜合數(shù)據平臺——RiceAtlas，科研人員利用該平臺快速改良“綏粳4號”水稻粒形。該項研究為水稻精準設計育種的智能決策提供了重要理論依據和數(shù)據支撐。
該研究得到國家自然科學基金、中國農業(yè)科學院科技創(chuàng)新工程等項目的支持。
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https://doi.org/10.1016/j.molp.2025.03.007
