3月13日，中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所水稻優(yōu)異種質(zhì)資源發(fā)掘與創(chuàng)新利用、作物種質(zhì)資源安全保存與信息化、作物生物信息與應(yīng)用創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)聯(lián)合，首次系統(tǒng)揭示了中國(guó)主要稻區(qū)水稻品種的形成特征，相關(guān)研究成果發(fā)表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
我國(guó)每年水稻種植面積超過(guò)4億畝，覆蓋了從熱帶到寒溫帶的各類氣候區(qū)，形成了各具特色的六大水稻種植區(qū)。經(jīng)過(guò)幾十年持續(xù)的遺傳改良，培育了成千上萬(wàn)個(gè)區(qū)域適應(yīng)性優(yōu)良品種。系統(tǒng)解析各稻區(qū)表型、基因型選擇特征，挖掘優(yōu)異種質(zhì)基因及其組合，對(duì)加速我國(guó)水稻精準(zhǔn)設(shè)計(jì)育種具有重要意義。
研究團(tuán)隊(duì)對(duì)我國(guó)五大主要稻區(qū)的6044份現(xiàn)代水稻品種進(jìn)行深度全基因組重測(cè)序，結(jié)合五大稻區(qū)19個(gè)鑒定點(diǎn)212組表型數(shù)據(jù)，系統(tǒng)闡明了不同稻區(qū)水稻品種基因組和表型選擇特征，多維度揭示了不同稻區(qū)品種適應(yīng)性以及人文選擇影響?；谝陨蠑?shù)據(jù)，鑒定到3131個(gè)與抽穗期、產(chǎn)量以及逆境響應(yīng)等關(guān)鍵農(nóng)藝性狀顯著相關(guān)的位點(diǎn)，并克隆到水稻粒形調(diào)控新基因 OsGL3.6 。進(jìn)一步結(jié)合已發(fā)表數(shù)據(jù)，完成了近萬(wàn)份水稻資源/品種的高密度變異圖譜的構(gòu)建，并開發(fā)在線育種輔助工具，打造了全球最大的水稻資源育種綜合數(shù)據(jù)平臺(tái)——RiceAtlas （https://www.cgris.net/RiceAtlas），研究人員利用該平臺(tái)快速改良“綏粳4號(hào)”水稻粒形。該項(xiàng)研究為水稻精準(zhǔn)設(shè)計(jì)育種的智能決策提供了重要理論依據(jù)和數(shù)據(jù)支撐。
作科所副研究員馬小定、博士研究生王浩、助理研究員閆燊等為論文共同第一作者，作科所韓龍植研究員、方溈研究員、賀強(qiáng)研究員等為論文的共同通訊作者。該研究得到國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、農(nóng)業(yè)生物育種重大專項(xiàng)、作物基因資源與育種全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、國(guó)家自然科學(xué)基金、中國(guó)農(nóng)科院科技創(chuàng)新工程等項(xiàng)目的資助。
文章鏈接：https://doi.org/10.1016/j.molp.2025.03.007
