近日，植保所天敵與授粉昆蟲利用創(chuàng)新團(tuán)隊在Nature旗下期刊Scientific Data（Q1，5-year IF = 8.9）發(fā)表題為“A chromosomal-level genome assembly of Trichogramma chilonis Ishii, 1941 （Hymenoptera: Trichogrammatidae）”的研究論文，解析了螟黃赤眼蜂（Trichogramma chilonis）的單倍型全基因組序列，是首個公開發(fā)布的赤眼蜂染色體水平的高質(zhì)量參考基因組。

 

　　赤眼蜂（Trichogramma spp.）是一種微小型卵寄生蜂，以各種鱗翅目害蟲的卵為食，常用于農(nóng)業(yè)害蟲管理。目前，這類微小型寄生蜂的高質(zhì)量基因組資源十分匱乏，阻礙了我們對該群體的種群進(jìn)化和寄生生態(tài)學(xué)的理解。本研究通過整合PacBio HiFi、Illumina和Hi-C數(shù)據(jù)，獲得了螟黃赤眼蜂（T. chilonis）的染色體水平基因組。基因組大小為202.48 Mb，N50長度為40.00 Mb。共有98.59% （199.63 Mb）的contigs被有效地映射到5條染色體上。BUSCO測序結(jié)果顯示，該基因組組裝完整性為98.1% （n = 1367），其中95%為單拷貝BUSCOs， 3.1%為重復(fù)BUSCOs。此外，基因組包含24.16% （48.91 Mb）重復(fù)序列和12,163個預(yù)測的蛋白質(zhì)編碼基因。本研究中所展示的高質(zhì)量的螟黃赤眼蜂基因組為闡明其進(jìn)化路徑和寄生生態(tài)潛在的分子機(jī)制提供了寶貴的資源。

 

　　山東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所為該文章的第一完成單位，植保所博士后王成興為文章第一作者，翟一凡研究員為文章通訊作者。該研究得到國家重點(diǎn)研發(fā)計劃和山東省泰山學(xué)者青年專家項目的支持。（撰稿：王成興； 核稿：周起先）