中國(guó)李是世界上商業(yè)化栽培最廣泛的李種之一，適應(yīng)性強(qiáng)，具有較高的經(jīng)濟(jì)價(jià)值與生態(tài)價(jià)值。近日，中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院鄭州果樹(shù)研究所李杏種質(zhì)改良團(tuán)隊(duì)與桃種質(zhì)資源團(tuán)隊(duì)聯(lián)合破譯了中國(guó)李高質(zhì)量基因組，為其重要經(jīng)濟(jì)性狀改良奠定遺傳學(xué)基礎(chǔ)，相關(guān)成果9月2日發(fā)表于《植物學(xué)雜志（The Plant Journal）》。

　　據(jù)黃振宇博士介紹，研究團(tuán)隊(duì)首先利用二代、三代及Hi-C等測(cè)序技術(shù)繪制了李杏種質(zhì)改良團(tuán)隊(duì)自主選育品種‘中李6號(hào)’基因組圖譜，其組裝質(zhì)量為現(xiàn)有最優(yōu)，為深度解析中國(guó)李基因組變異規(guī)律、分子育種及優(yōu)異基因發(fā)掘奠定了重要基礎(chǔ)。

 

　　在此基礎(chǔ)上，該研究又進(jìn)行了全基因組高深度重測(cè)序數(shù)據(jù)分析，共鑒定到3,380,659個(gè)高質(zhì)量SNPs，將74份中國(guó)李核心種質(zhì)聚類為南、北、東北及國(guó)外品種群，發(fā)現(xiàn)南方品種群較為原始，遺傳多樣性豐富，且與其他品種群間存在基因交流，從遺傳學(xué)層面再次證實(shí)我國(guó)長(zhǎng)江流域?yàn)橹袊?guó)李原始馴化中心。

 

　　中國(guó)李適應(yīng)性極強(qiáng)，在我國(guó)南至廣東省、北至黑龍江省，均有大面積栽培，但關(guān)于其適應(yīng)性機(jī)制鮮有報(bào)道。研究對(duì)不同品種群間進(jìn)行選擇壓分析，共鑒定到35個(gè)受選擇位點(diǎn)，其中，開(kāi)花調(diào)控、抗病抗逆及類黃酮代謝等重要途徑關(guān)鍵基因顯著富集，此外，基因家族的擴(kuò)張和收縮分析表明，以上幾類基因家族在基因組進(jìn)化過(guò)程中顯著擴(kuò)張，初步揭示了中國(guó)李重要性狀馴化的分子基礎(chǔ)，為后續(xù)發(fā)掘中國(guó)李適應(yīng)性相關(guān)優(yōu)異基因提供重要參考。

 

　　該研究得到國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、中國(guó)農(nóng)科院科技創(chuàng)新工程等項(xiàng)目的資助。

 

　　原文鏈接：https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/tpj.15482