3月17日,中國農業(yè)科學院作物科學研究所特色農作物優(yōu)異種質資源發(fā)掘與創(chuàng)新利用創(chuàng)新團隊聯合國內外多家單位,構建了中國蠶豆特異種質的高質量參考基因組,解析了蠶豆基因組進化特征、群體遺傳結構與重要性狀分子基礎,發(fā)掘了蠶豆種質特異短翼瓣性狀相關候選基因,為蠶豆適應性分化、基因挖掘、種質創(chuàng)新和育種改良提供了基因組資源及數據支撐。相關研究成果以研究長文的形式在線發(fā)表在《基因組生物學(Genome Biology)》上。
蠶豆是一種糧菜飼綠肥兼用的春播區(qū)一年生或秋播區(qū)越年生的冷季食用豆類,因其營養(yǎng)價值豐富,產量潛力巨大,且具有顯著生態(tài)優(yōu)勢,在農業(yè)可持續(xù)發(fā)展中發(fā)揮著重要作用。作為擁有超過1萬年馴化歷史的古老作物,蠶豆種質資源蘊藏著豐富的遺傳多樣性。然而,蠶豆龐大且復雜的基因組嚴重制約了其理論和應用研究。
研究團隊利用中國蠶豆特異種質VF8137,組裝出了該種質11.81Gb大小的高質量參考基因組,提供了高質量精細物理圖譜和注釋?;谠摶蚪M利用遺傳定位分析,發(fā)掘出一個關鍵候選基因Vfab3G363000,結合功能注釋、序列變異、表達差異和蛋白質結構變異分析等多方面的證據,表明該基因的突變導致了VF8137獨特的短翼瓣性狀,顯著降低蠶豆的異交率,使其表現出自花授粉的特點;隨后,還依托該基因組鑒定出一批與產量性狀相關的基因和位點。這些基因的充分開發(fā),將有助于縮短蠶豆品種的純化周期,促進優(yōu)異目標性狀的快速固定,為低異交率、高產蠶豆種質創(chuàng)新和培育提供了寶貴的基因資源。同時,研究團隊通過對558份全球蠶豆種質資源群體遺傳結構和地理分化進行系統(tǒng)解析,從群體遺傳學角度為中國蠶豆南北方生態(tài)分化的遺傳演進提供了關鍵線索。
作科所劉榮副研究員、博士研究生李孟偉等為論文的共同第一作者。作科所楊濤研究員、宗緒曉研究員等為論文的共同通訊作者。該研究得到云南省科技計劃項目、國家食用豆產業(yè)技術體系、國家自然科學基金、國家重點研發(fā)計劃、農作物種質資源保護與利用專項、作物基因資源與育種全國重點實驗室、中國農業(yè)科學院科技創(chuàng)新工程等項目的資助。
文章鏈接:https://doi.org/10.1186/s13059-025-03532-7
